GebbaMA, il laboratorio virtuale per i dati di microarray

GebbaMA è un ambiente web per la gestione dei dati di microarray. E’ stato progettato e realizzato all’interno di GEBBAlab, un progetto finanziato dalla regione Emilia Romagna e rivolto a supportare la comunità clinico-scientifica in ambito genetico.

Lo strumento, specifico per il trattamento di dati prodotti dalla tecnica dei microarray, dispone di funzionalità di base quali upload, download, search degli esperimenti ed annotazione delle informazioni genetiche, cliniche e sperimentali, ma anche di quelle più avanzate di ricerca federata tra installazioni distribuite geograficamente e di organizzazione degli esperimenti in progetti.

Benefits

L’ambiente è stato realizzato facilitando il più possibile l’utente nella fase di sottomissione dei propri esperimenti e garantendogli un alto grado di personalizzazione nella fase di archiviazione:

• Upload e download multiplo degli esperimenti
• Annotazione automatica (nessuna form da compilare!) delle informazioni genetiche, cliniche e sperimentali prodotte in laboratorio
• Controllo automatico di alcune annotazioni (organismo, provider dell’array, nome dell’array) secondo le ontologie di riferimento
• Possibilità di gestire gli esperimenti singolarmente o di organizzarli in uno più progetti
• Interoperabilità tra laboratori distribuiti geograficamente